Štruktúru fakulty tvoria Katedra manažmentu a rozvoja ľudských zdrojov, Katedra verejnej správy a regionálneho rozvoja, Katedra ekonómie a ekonomiky, Katedra sociálnych a humanitných vied.

Fakulta vydáva vedecký časopis Sociálno-ekonomická revue. Súčasťou výskumnej činnosti fakulty sú projekty ako Vplyv podpornej politiky na vybrané ekonomické ukazovatele poľnohospodárskych podnikov v SR či Přeshraniční klastrová iniciativa pro rozvoj kreativního průmyslu.