V súčasnosti je vedecko-výskumná činnosť pracoviska orientovaná na dve oblasti.

Na problematiku transplantácie tenkého čreva v experimente a na problematiku ischemicko-reperfúzneho poškodenia mozgu a miechy.V rámci transplantačného programu sa pracovníci ústavu zameriavajú na komplexnú analýzu histopatologického obrazu, expresiu cytokínov a génov pre apoptózu resp. nekrózu na modeloch ischémie-reperfúzie, autotransplantácie a alotransplantácie čreva u laboratórnych zvierat.

V súčasnom období ústav rieši 4 grantové úlohy: Syndróm multiorgánovej dysfunkcie po ischémii-transplantácii tenkého červa, Ischemicky a farmakologicky podmienená tolerancia neurónov v mieche králika a jej vplyv na syntézu bielkovín, Zápalové a apoptotické zmeny v sliznici tenkého čreva po alotransplantácii u potkana s následným vývojom MODS a Štúdium vplyvu opakovaného stresu na motorické neuróny v sivej hmoty miechy králika.