Vedeckovýskumná činnosť oddelenia mineralógie a kryštalografie je zameraná na štúdium minerálnych para-enéz horninotvorných minerálov, mineralogickú prospekciu ekonomicky významných minerálov, minerogenetický a metalogenetický výskum a štúdium kryštálových štruktúr minerálov.

Katedra rieši projekt Metaultramafity, indikátor mechanizmov kôrovo-plášťovej interakcie, recyklácie a exhumácie v orogénnej prizme.