Oddelenie je zamerané na perspektívne oblasti štúdia nových analytických postupov a teoretických prístupov so zameraním na riešenie problémov predovšetkým potravinárskeho, farmaceutického priemyslu a životného prostredia.

Oddelenie analytickej chémie zabezpečuje pedagogickú a vedecko-výskumnú činnosť v nasledovných oblastiach: stopová a ultrastopová analýza organických a anorganických látok s využitím predkoncentračných techník v „off-line“ i „on-line“ systémoch,  analýzy vôd, pôdy a ovzdušia, separácia a stanovenie enantiomérov vo vzorkách životného prostredia, vo farmaceutických výrobkoch a v biologickom materiáli, štúdium štruktúry vybraných zlúčenín v spojení s ich vlastnosťami, stopová a ultrastopová elektrochemická a spektrofotometrická analýza mnohých prvkov s dôrazom na prítomnosť ťažkých kovov v zložitých matriciach, využitie DNA biosenzorov na stanovenie rizikových chemikálií v stopových koncentráciách, stanovenie aktivátorov a inhibítorov štruktúrneho poškodenia DNA, stopová analýza prchavých a semiprchavých analytov v zložitých organických sústavách s využitím predkoncentračných techník v kombinácii s rýchlou kapilárnou plynovou chromatografiou a hmotnostnou spektrometriou.

Súčasťou výskumnej činnosti oddelenia sú aj projekty ako Vývoj a inštalácia systému skorého varovania na zabezpečenie kvality pitnej vody, zlepšenie odhadu rizík a prevencie v Novom Sade, Srbsko či Interakcie biologicky aktívnych látok s nanomateriálmi a ich využitie v (bio)senzoroch.