Štruktúru fakulty tvorí osem katedier.

Patria medzi ne Katedra biológie a ekológie, Katedra životného prostredia, Katedra fyziky, Katedra geografie, geológie a krajinnej ekológie, Katedra chémie, Katedra informatiky, Katedra matematiky, Katedra techniky a technológií.