História fakulty sa odvíja od školského roku 1940/41, keď bol na Odbore chemickotechnologického inžinierstva otvorený pre päť externých učiteľov a asi sto poslucháčov prvý akademický rok.

Je jedinou fakultou poskytujúcou úplné vysokoškolské vzdelanie založené na kvalitnom chemicko-inžinierskom a prírodovednom teoretickom základe, vychovávajúcou inžinierov pre všetky odvetvia chemického a potravinárskeho priemyslu.

Organizačnú štruktúru tvoria Ústav analytickej chémie, Ústav anorganickej chémie, technológie a materiálov, Ústav biochémie, výživy a ochrany zdravia, Ústav biotechnológie a potravinárstva, Ústav fyzikálnej chémie a chemickej fyziky, Ústav chemického a environmentálneho inžinierstva, Ústav informatizácie, automatizácie a matematiky, Ústav organickej chémie, katalýzy a petrochémie, Ústav polymérnych materiálov, Oddelenie jazykov, Oddelenie telesnej výchovy a športu.