V rámci základného výskumu sa ústav zaoberá kardiovaskulárnou farmakológiou.

V rámci tejto činnosti sa hodnotí vplyv vazoaktívnych látok na cievnu reaktivitu, na rôznych modeloch endotelovej dysfunkcie, resp. poškodenia endotelu sa sledujú endotelovo-protektívne vlastnosti farmák a kvantifikujú sa endotelové markery. V spolupráci s klinickými pracoviskami sa hodnotia markery endotelovej dysfunkcie u pacientov s kardiovaskulárnym rizikom.

Na pracovisku sú riešené nasledovné grantové projekty: Štúdium endotelovo-protektívnych účinkov farmák na experimentálych modeloch poškodenia endotelu, Percepcia rizika – kľúčový faktor ich utilizácie, Neuroendokrinné mechanizmy vo vzťahu k psychickému stavu a k účinkom psychofarmák, Ischemicko reperfúzne poškodenie v experimentálnom diabete typu 2 a možnosti jeho farmakologického ovplyvnenia a Nové počítačové metódy pre analýzu osudu a účinku biologicky aktívnych látok.