Organizačnú štruktúru katedry tvoria Ústav epizootológie a preventívnej veterinárskej medicíny a Ústav parazitológie.

Katedra je súčasťou centra excelentnosti INFEKTOZOON, ktoré rieši problematiku nákaz zvierat a zoonózy a Centra excelentnosti pre parazitológiu.

Súčasťou výskumnej činnosti je aj riešenie vedeckých projektov ako napr. Understanding and combating porcine reproductive and respiratory syndrome in Europe, Klasický, genomický a proteomický prístup pri skúmaní ekonomicky významných vírusových nákaz hospodárskych zvierat či Cytokíny a exprimovanie receptorov na imunokompetentných bunkách v aktívnej fáze salmonelovej infekcie u kurčiat a sliepok.