Katedra hydrogeológie rieši široké spektrum úloh základného a aplikovaného hydrogeologického výskumu najmä so zameraním na metódy výskumu, prieskumu a ochrany podzemných vôd.

Rozvíja metódy skúmania kvantitatívnych a kvalitatívnych vlastností prírodných vôd, modelovania a prognózovania.

Katedra rieši projekty ako Identifikácia a hodnotenie sucha v režime hladiny podzemnej vody, Formovanie krasových vôd Silickej planiny so zameraním na hydrogeologický systém Krásnohorskej jaskyne, alebo Optimalizácia odvodnenia banského diela pomocou numerického modelovania.