Ústav vznikol ako Kabinet fyziky SAV (Slovenskej akadémie vied).

Výskum ústavu je orientovaný na fyziku kondenzovaných látok (materiály pripravené rýchlym ochladením, kovové multivrstvy, iónové vodiče a senzory, teória nízkorozmerných systémov), jadrovú fyziku (štruktúra jadra, mechanizmus jadrových reakcií, využitie pozitrónov), subjadrovú fyziku (fenomenológia vysokoenergetických zrážok, neporuchové QCD metódy, vlastnosti hadrónového spektra) a na kvantovú optiku.

Organizačnú štruktúru tvoria: Oddelenie komplexných fyzikálnych systémov, Oddelenie fyziky kovov, Oddelenie multivrstiev a nanoštruktúr, Oddelenie jadrovej fyziky, Centrum pre výskum kvantovej informácie, Oddelenie teoretickej fyziky a Detašované pracovisko Spoločné pracovisko ElÚ a Fyzikálneho ústavu SAV.

Ústav je rozsiahle zapojený do systému európskych projektov a spolupracuje s významnými strediskami svetovej fyziky (CERN – Ženeva, ICTP – Terst, SÚJV Dubna, atď.).

Ústav vydáva časopis Acta Physica Slovaca.

V prípade záujmu o spoluprácu, kontaktujte Kanceláriu pre transfer technológií, poznatkov a ochranu duševného vlastníctva Slovenskej akadémie vied.