Hlavné oblasti výskumu ústavu sú 1) Analýza ľudských reprodukčných strát: morfologická (detekcia porúch vývoja embrya/plodu), chromozómová (detekcia chromozómových aberácií) a DNA analýza (PCR, RT PCR, VNTR), 2) Diferenciálna diagnostika Gestačnej trofoblastovej choroby v rámci Centra pre gestačnú trofoblastovú chorobu SR, 3) Tkanivové inžinierstvo : in vitro príprava autológnych implantátov, testovanie  syntetických extracelulárnych matríc, bunková terapia (somatické kmeňové bunky), 4) Testy cytotoxicity a genotoxicity v in vitro podmienkach a 5) Bunková banka enzymopátií pre DFNs.