Katedra farmakológie a toxikológie sa člení na 3 ústavy: Ústav farmakológie, Ústav toxikológie a Ústav humánnej a klinickej farmakológie.

Vedeckovýskumná činnosť katedry je zameraná na štúdium účinkov liečiv, pesticídov a iných xenobiotík na organizmus človeka a zvierat, ako aj pomocou alternatívnych in vitro testov.