Katedru môžeme rozdeliť na časť mikrobiológie a časť virológie.

Súčasťou mikrobilógie sú Laboratórium lekárskej mikrobiológie, ktoré skúma napr. odpor a virulentné faktory patogénnych baktérií a plesní a Laboratórium molekulárnej mikrobiológie, ktoré sa zaoberá funkčnou genomikou kvasiniek.

Virologickú časť tvorí Laboratórium virológie, ktoré sa zaoberá štúdiom patogenézy a imunológie myšacieho onkogénneho herpetického vírusu, ktorý izolovali v roku 1980 a dnes je svetovo uznávaným modelom pre štúdium EBV infekcie u ľudí.