Počiatky terajšej katedry siahajú do roku 1939, keď na Odbore inžinierskeho staviteľstva vznikol Ústav I. staviteľstva a hospodárstva vodného.

Pedagogická a vedecká profilácia je formulovaná vednými a technickými disciplínami, ako sú: chémia vody, čistota vôd, vodárenstvo a úprava vôd, stokovanie a čistenie odpadových vôd, hospodárenie s vodou, odpadové hospodárstvo, environmentálne inžinierstvo a pod.

Vedeckovýskumná činnosť sa rozvíja v súlade so súčasnými svetovými trendmi - katedra rieši niekoľko domácich grantov  (VEGA, KEGA, APTV) i európskych projektov (COCT, ESF, EVK) z oblasti ochrany kvality vodných zdrojov a ich využívania, oblasti hydrauliky stôk, hydrológie urbanizovaných území, degradácie organických látok v skládkach odpadu a pod.).