Ústav bol založený v roku 2000 ako centrum pre rozvoj alpínskeho biologického výskumu v Západných Karpatoch.

Jeho hlavným poslaním je výskum na všetkých úrovniach biologickej organizácie, od molekúl až po alpínske ekosystémy. Ďalšou dôležitou úlohou ústavu je napomáhať porozumeniu a ochrane vysokohorských ekosystémov.

Organizačnú štruktúru ústavu tvoria Oddelenie botaniky, Oddelenie zoológie, Oddelenie molekulovej biológie a mikrobiológie a Laboratórium bioinformatiky.

Súčasťou výskumu je aj riešenie projektových úloh ako Kvalita vody horskych ekosystémov (prostredia) Kirgizska.