Katedra bola založená v roku 1991.

Vedecko-výskumná činnosť katedry je zameraná na výskum vybraných spoločenstiev vodných a suchozemských biotopov s cieľom štúdia ich štruktúry a časovo-priestorovej dynamiky a prispieť k pochopeniu ich fungovania ako dôležitého predpokladu účinnej druhovej a územnej ochrany. Výstupy z výskumov majú perspektívu uplatnenia tiež v biotickom monitorovaní kvality prostredia.