Katedra cirkevných dejín, byzantológie a gréckeho jazyka je zameraná na štúdium histórie a štruktúry Cirkvi od jej vzniku až po dnešnú dobu s vedeckým a objektívnym skúmaním dejinných súvislostí. Zvláštna pozornosť je venovaná dejinám Pravoslávnej cirkvi na území Veľkej Moravy a neskôr na území Čiech, Moravy a Slovenska.