Ústav hygieny a technológie mäsa je zameraný na oblasť hygieny produkcie a spracovania zdravotne neškodných potravín a surovín živočíšneho pôvodu.

Vo svojej vedecko-pedagogickej činnosti je ústav zameraný na oblasti hygieny a technológie červeného mäsa a mäsových výrobkov, hydinového mäsa a hydinových výrobkov, vajec a vaječných výrobkov, rýb a rybacích výrobkov, mäsa lovnej zveri, hygieny medu, potravinárskej mikrobiológie, hygieny a spracovanie vedľajších potravinárskych produktov, ako aj činnosti spojené s výkonom úradného veterinárneho lekára v študijných programoch Všeobecné veterinárske lekárstvo a Hygiena potravín.