Laboratórium biomedicínskej mikrobiológie a imunológie je zamerané na výskum v oblasti interakcií hostiteľ-patogén so zameraním na: a) mutácie v génoch nešpecifickej imunity vo vzťahu k náchylnosti na ochorenia; b) rozdiely v patogenéze infekčného agensu k hostiteľskému organizmu na molekulárnej úrovni; c) mechanizmy úniku patogénu hostiteľskému imunitnému systému (mechanizmy invázie).