Katedra životného prostredia bola ustanovená v roku 1990 a vznikla z Ústavu zoohygieny vtedajšej Katedry mikrobiológie, imunológie a zoohygieny.

Na základe novej organizačnej štruktúry r. 2007 bola vytvorená Katedra životného prostredia, veterinárskej legislatívy a ekonomiky s Ústavom hygieny zvierat a životného prostredia a Ústavom súdneho a verejného veterinárskeho lekárstva a ekonomiky.