Prioritami Centra pedagogického výskumu (ďalej CPV) sú realizácia výskumu, vývoja a evalvácie v oblasti pedagogiky, lokálna, národná a medzinárodná spolupráca vo výskume, transfer poznania do praxe, vytváranie adekvátnejších podmienok pre výskum, konštituovanie ľudských zdrojov so zreteľom na ich obnovu a domáce i zahraničné uznanie a skvalitňovanie pozície vedy a vedcov v spoločnosti.