V súlade dlhodobou vedecko-výskumnou profiláciou pracoviska je prioritou katedry riešenie nasledovných problémov:

• hodnotenie kvality surovín pre výrobu potravín,
• hodnotenie kvality pšenice určenej na potravinárske účely v závislosti od pestovateľských podmienok,
• využitie biologicky aktívnych zložiek rastlinných surovín pri výrobe potravín s definovanými vlastnosťami (potravín s pridanou hodnotou),
• hodnotenie antioxidačnej aktivity rastlinných surovín a potravín, environmentálne, fytopatologické a toxikologické aspekty fuzarióz obilnín vo vzťahu k potravinovej bezpečnosti cereálnych produktov,
• optimalizácia režimu prípravy pšeničného cesta,
• sledovanie a hodnotenie reologických modelov správania sa pekárskych polotovarov a ich vzťah ku kvalite finálnych výrobkov,
• optimalizácia pekárskych technológií,
• hodnotenie kvality sladovníckeho jačmeňa z hľadiska jeho ďalšieho spracovania na slad a pivo,
• optimalizácia sladovníckych a pivovarských technológií,
• senzorické hodnotenie kvality potravín,
• optimalizácia technológií výroby vína. charakteristika a klasifikáciu aromatických látok vo víne.