Výskum sa zameriava na skúmanie hydrológie terénnych mikrodepresií a depresných oblasti, na vplyv antropogénnej činnosti na vodný režim nížinného územia, na vodný režim v poľnohospodársky využívaných oblastiach a na možnosti jeho regulácie, na vodnú bilanciu nížinných oblasti, jej časovú a priestorovú variabilitu a kvalitatívnu charakteristiku povrchových a podzemných vôd a ich monitorovanie.

Oddelenie spolupracuje na grantových projektoch s vedecko-výskumnými inštitúciami ako Slovenský hydrometeorologický ústav Bratislava (pracovisko Košice), Slovenská agentúra životného prostredia, Centrum ochrany prírody a krajiny Banská Bystrica (pracovisko Michalovce), alebo Oblastný výskumný ústav agroekológie v Michalovciach.

V prípade záujmu o spoluprácu, kontaktujte Kanceláriu pre transfer technológií, poznatkov a ochranu duševného vlastníctva Slovenskej akadémie vied.