Ústav hygieny a technológie mlieka je vo svojej vedecko-pedagogickej činnosti zameraný na štúdiom kravského, ovčieho a kozieho mlieka z hľadiska hygienického a z hľadiska základných spôsobov jeho technologického spracovania. Venuje sa oblasti minimalizácie zdravotného rizika z komodít mlieka a mliečnych výrobkov. Okrem toho je zameraný na oblasť správnej výživy ľudí, oblasť hygieny a technológie rastlinných komodít, oblasť potravinárskej techniky a technológií, na oblasť senzorických analýz potravín v rámci spoločného špecializovaného pracoviska na IVVL Košice.

Súčasťou výskumnej činnosti je aj riešenie vedeckých projektov ako napr. Analýza nebezpečenstva narušenia kvality, hygienickej neškodnosti a zdravotnej bezpečnosti potravinových zložiek.