Katedra sa profiluje ako pracovisko zamerané na ochranu a tvorbu životného prostredia a zoológiu.

V oblasti ochrany a tvorby životného prostredia sa zaoberá pôdou vodou, ovzduším, ako základnými zložkami životného prostredia, ochranou prírody a krajiny, opatreniami na dosiahnutie a udržanie ekologickej stability krajiny,  dopadmi ľudskej činnosti,  predovšetkým poľnohospodárstva na životné prostredie a monitoringom životného prostredia.

Pracovníci katedry sa vo vedecko – výskumnej práci orientujú na:

• hodnotenie kvality vody v rôznych biotopoch chránených mokradí v Slovenskej republike,
• vplyv rôznych ekosystémov na kvalitu vody vo vodných tokoch,
• makrozoobentos ako indikátor kvality povrchových vôd,
• dynamikou dusíka v pôde v súvislosti s tendenciou udržateľného poľnohospodárstva a globálnou zmenou klímy,
• dynamiku zmien vybraných frakcií síry v pôde,
• diverzita epigeických skupín s dôrazom na čeľaď Carabidae v poľnohospodárskych a prírodných ekosystémoch,
•  vplyv potenciálne toxických prvkov na životné prostredie, so zameraním sa na štúdium sedimentačného prostredia vodných tokov a nádrží,
• funkčná diverzita pestríc (Diptera, Syrphidae) v ekosystémoch poľnohospodárskej krajiny.